Visualisasi kelompok urutan (clades). Kredit: Biologi Komunikasi (2025). Doi: 10.1038/s42003-024-07262-7
Sudah lima tahun sejak Covid-19 dinyatakan sebagai pandemi global. Saat SARS-COV-2 bergeser ke status endemik, pertanyaan tentang evolusi di masa depan tetap ada. Varian baru dari virus kemungkinan akan muncul, didorong oleh seleksi positif untuk sifat -sifat seperti peningkatan penularan, durasi infeksi yang lebih lama dan kemampuan untuk menghindari pertahanan kekebalan tubuh. Perubahan -perubahan ini dapat memungkinkan virus untuk menyebar di antara populasi yang sebelumnya diimunisasi, berpotensi memicu gelombang infeksi baru.
Memprediksi mutasi baru dalam virus sangat penting untuk memajukan penelitian sains kehidupan, terutama ketika mencoba memahami bagaimana virus berkembang, menyebar dan mempengaruhi kesehatan masyarakat. Secara tradisional, para peneliti mengandalkan eksperimen lab basah untuk mempelajari mutasi. Namun, percobaan ini bisa mahal dan memakan waktu.
Para peneliti dari College of Engineering dan Computer Science di Florida Atlantic University telah mengembangkan metode baru untuk memprediksi mutasi dalam sekuens protein yang disebut Deep Novel Mutation Search (DNMS), jenis model kecerdasan buatan yang menggunakan jaringan saraf dalam.
Untuk penelitian ini, mereka fokus pada protein spike SARS-COV-2-bagian dari virus yang bertanggung jawab untuk membantunya memasuki sel manusia-dan menggunakan model bahasa protein untuk memprediksi potensi mutasi baru dalam protein ini yang belum pernah dilihat sebelumnya.
Untuk melakukan ini, para peneliti menggunakan model bahasa, Protbert, yang secara khusus disesuaikan untuk memahami “dialek” protein spike SARS-COV-2. Model ini bekerja dengan melihat mutasi potensial dan memberi peringkat berdasarkan pada beberapa faktor. Ini termasuk gramatikalitas, yang mengacu pada seberapa mungkin atau “memperbaiki” mutasi sesuai dengan aturan tata bahasa yang dipelajari oleh model, serta seberapa mirip urutan bermutasi dengan protein asli, yang diukur dengan perubahan semantik dan perubahan perhatian.
Hasil penelitian, yang diterbitkan dalam jurnal Communications Biology, menunjukkan bahwa model bahasa DNMS dapat memisahkan urutan menjadi kelompok berdasarkan kesamaan mereka. Model dapat memprediksi mutasi mana yang mungkin terjadi dengan mencari mutasi yang hanya menyebabkan perubahan kecil dalam struktur dan fungsi protein. Ini penting karena, dalam kebanyakan kasus, virus seperti SARS-COV-2 berkembang melalui perubahan kecil yang memungkinkan mereka untuk beradaptasi tanpa secara drastis mengubah fungsi keseluruhan mereka.
Metode DNMS menggunakan semua informasi yang tersedia tentang urutan dan mutasi untuk membuat prediksi yang lebih akurat tentang mutasi mana yang mungkin terjadi. Tidak seperti penelitian sebelumnya, yang biasanya melihat perubahan pada urutan protein referensi, DNM memperkenalkan model prediksi mutasi orangtua-anak. Urutan induk (urutan protein yang ada) digunakan untuk memprediksi mutasi, dan mutasi ini dianalisis berdasarkan bagaimana mereka dapat berkembang seiring waktu.
“Model kami memberi peringkat semua mutasi yang mungkin untuk menemukan yang paling mungkin terjadi di masa depan,” kata Xingquan “Hill” Zhu, Ph.D., penulis senior dan profesor di Departemen Teknik Elektro dan Ilmu Komputer FAU. “Studi kami menunjukkan bahwa mutasi yang mengikuti tata bahasa protein, dengan perubahan minimal dibandingkan dengan urutan asli dan perbedaan perhatian yang rendah, dianggap sebagai mutasi di masa depan yang paling mungkin.”
Pohon filogenetik dari urutan SARS-COV-2, dibangun dengan Nextstrain, menampilkan urutan yang diwarnai oleh clade mereka dan diorganisir berdasarkan tanggal pengumpulan. Seiring waktu, urutan bermutasi dan berbeda, membentuk clades baru, seperti dialek dalam bahasa alami. Tidak seperti metode tradisional yang berfokus pada mutasi dari urutan referensi asli, penelitian baru ini menggabungkan hubungan orangtua-anak dalam evolusi virus. Ini mengevaluasi mutasi tidak hanya dalam kaitannya dengan urutan referensi tetapi juga dengan menilai dampaknya pada tata bahasa, semantik, dan perhatian dari urutan protein untuk mengidentifikasi mutasi yang paling signifikan. Kredit: Universitas Atlantik Florida
Metode ini pertama-tama mengambil urutan protein spike SARS-COV-2 yang diberikan dan mensimulasikan semua mutasi titik tunggal yang mungkin. Untuk setiap versi protein yang bermutasi, DNMS menggunakan model Protbert untuk menghitung seberapa besar kemungkinan mutasi mengikuti “tata bahasa” protein (gramatikalitas) dan seberapa mirip urutan bermutasi dengan urutan asli (perubahan semantik). Selain itu, model ini melihat perhatian, suatu ukuran yang telah digunakan untuk mempelajari struktur dan fungsi protein, tetapi tidak pernah sebelumnya diterapkan pada prediksi mutasi.
“Kunci metode kami terletak pada penggunaan konteks yang disediakan oleh urutan induk. Konteks ini sangat penting untuk mengevaluasi apakah potensi mutasi selaras dengan ‘tata bahasa’ protein,” kata Zhu. “DNMS bekerja dengan memilih urutan induk dari pohon filogenetik – pada dasarnya pohon keluarga strain virus – dan mensimulasikan semua mutasi yang mungkin.”
Studi ini juga melihat hubungan antara mutasi yang diprediksi dan kebugaran virus, atau seberapa baik ia dapat mereplikasi dan bertahan hidup. Temuan menunjukkan bahwa mutasi dengan tata bahasa yang tinggi, perubahan semantik kecil, dan perubahan perhatian rendah dikaitkan dengan kebugaran virus yang lebih tinggi. Ini menunjukkan bahwa mutasi yang pas dalam “aturan” biologis dari protein dan menyebabkan gangguan minimal pada struktur atau fungsi protein lebih mungkin bermanfaat bagi virus.
“Kami percaya bahwa menggunakan data urutan saja dapat membantu membuat prediksi ini, karena protein mengikuti aturan biologis tertentu,” kata Zhu.
Para peneliti menguji efektivitas DNM melalui analisis statistik. Hasilnya menunjukkan bahwa DNM mengungguli metode lain dalam memprediksi mutasi baru karena menggabungkan semua faktor yang relevan menjadi model prediksi tunggal yang lebih akurat.
“Model bahasa pra-terlatih yang disempurnakan, yang dikembangkan oleh para peneliti kami dapat memprediksi mutasi SARS-COV-2 mana yang lebih mungkin terjadi di masa depan,” kata Stella Batalama, Ph.D., dekan College of Engineering dan Ilmu Komputer.
“Metode ini dapat berguna untuk memandu penelitian eksperimental, karena memberikan prediksi tentang mutasi sebelum mereka diamati pada populasi, membantu pejabat kesehatan masyarakat melacak dan mempersiapkan mutasi baru sebelum mereka menyebar secara luas.”
Rekan penulis penelitian ini adalah Magdalyn E. Elkin, seorang mahasiswa doktoral di Departemen Teknik Listrik dan Ilmu Komputer FAU.
Informasi lebih lanjut: Magdalyn E. Elkin et al, memperhatikan dialek SARS-COV-2: pendekatan jaringan saraf yang dalam untuk memprediksi mutasi protein baru, Biologi Komunikasi (2025). Doi: 10.1038/s42003-024-07262-7
Disediakan oleh Florida Atlantic University
Kutipan: AI belajar untuk ‘berbicara’ dialek ‘genetik’ untuk prediksi mutasi SARS-COV-2 di masa depan (2025, 27 Maret) Diperoleh 27 Maret 2025 dari https://medicalxpress.com/news/2025-03-ai-ai-genetic-dialect-future-sars.html
Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari transaksi yang adil untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang dapat direproduksi tanpa izin tertulis. Konten hanya disediakan untuk tujuan informasi.
ADVERTISEMENT:
Kesehatan
info Kesehatan
cara hidup sehat
makanan sehat
suara88
sumo7777
supermoney888
teratai88
thor88
togelhk88
topjitu88
totosloto88
trisula888
udangbet88
via88
virusjp88
warga888
waw88
winjitu88
wisdom88
wnitogel88
yoyo888
validtoto88
sule999
sule88
ss888bet
sia77
seluang88
satu88
satu777
rp88
rp88
rp88
qiuqiu88
pt88
pt77
produk88
mt88
mt77
menang66
latobet888
kedai96
kedai188
ids88
hp88
hp77
gm88
gm77
final888
duit88
duit168
divisi88
dewi500
devil88
cuputoto88
cukongbet88
bom888
bintaro888
askasino88
999aset
afb77
aset99
bendera77
bendera888
coco88
cuma77
cuma88
dwv88
fafajp88
gemar88
gocap88
gocaptoto
hakabet88
hwtoto88
ina77
ina88
jingga8888
juragan777
kastil77
kebo888
kkwin77
kokoslot88
luckydf88
microstar888
monperatoto88
mpo1122
mpo122
mpopelangi88
pamanslot88
panel88
paragon77
paragon888
pion77
prada88
prada888
qqslot88slot
rejekibet88
rezekibet88
sensa77
sensa888
singajp88
sr77
sr88
surya77
surya88
tajir77
tajir88
toto122
toto123
uangvip88
wajik77
777neko
88judi
99judi
abcslot88
suara88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://suara88.biz/
sumo7777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sumo7777.com/
supermoney888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://supermoney888.biz/
teratai88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://teratai88.biz/
thor88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://thor88.biz/
togelhk88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://togelhk88.net/
topjitu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://topjitu88.net/
totosloto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://totosloto88.com/
trisula888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://trisula888.biz/
udangbet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://udangbet88.net/
via88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://via88.biz/
virusjp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://virusjp88.net/
warga888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://warga888.biz/
waw88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://waw88.biz/
winjitu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://winjitu88.net/
wisdom88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://wisdom88.biz/
wnitogel88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://wnitogel88.com/
yoyo888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://yoyo888.biz/
validtoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://validtoto88.com/
sule999 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sule999.com/
sule88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sule88.org/
ss888bet permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ss888bet.com/
sia77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sia77.info/
seluang88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://seluang88.com/
satu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://satu88.biz/
satu777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://satu777.asia/
rp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rp88.biz/
rp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rp88.asia/
rp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rp77.live/
qiuqiu88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://qiuqiu88.biz/
pt88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pt88.org/
pt77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pt77.info/
produk88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://produk88.asia/
mt88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mt88.org/
mt77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mt77.biz/
menang66 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://menang66.biz/
latobet888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://latobet888.org/
kedai96 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kedai96.org/
kedai188 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kedai188.biz/
ids88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ids88.biz/
hp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hp88.org/
hp77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hp77.org/
gm88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gm88.asia/
gm77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gm77.net/
final888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://final888.org/
duit88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://duit88.asia/
duit168 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://duit168.biz/
divisi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://divisi88.org/
dewi500 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://dewi500.biz/
devil88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://devil88.info/
cuputoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://cuputoto88.com/
cukongbet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://cukongbet88.asia/
bom888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bom888.biz/
bintaro888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bintaro888.info/
askasino88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://askasino88.org/
999aset permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://999aset.com/
afb77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://afb77.biz/
aset99 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://aset99.biz/
bendera77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bendera77.biz/
bendera888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bendera888.com/
coco88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://coco88.org/
cuma77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://cuma77.biz/
cuma88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://cuma88.org/
dwv88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://dwv88.org/
fafajp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://fafajp88.com/
gemar88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gemar88.biz/
gocap88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gocap88.info/
gocaptoto permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gocaptoto.asia/
hakabet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hakabet88.com/
hwtoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://hwtoto88.org/
ina77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ina77.biz/
ina88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ina88.info/
jingga8888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jingga8888.com/
juragan777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://juragan777.asia/
kastil77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kastil77.info/
kebo888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kebo888.biz/
kkwin77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kkwin77.com/
kokoslot88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kokoslot88.asia/
luckydf88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://luckydf88.org/
microstar888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://microstar888.biz/
monperatoto88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://monperatoto88.com/
mpo1122 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mpo1122.biz/
mpo122 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mpo122.biz/
mpopelangi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mpopelangi88.com/
pamanslot88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pamanslot88.biz/
panel88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://panel88.org/
paragon77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://paragon77.biz/
paragon888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://paragon888.info/
pion77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pion77.biz/
prada88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://prada88.asia/
prada888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://prada888.com/
qqslot88slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://qqslot88slot.com/
rejekibet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rejekibet88.com/
rezekibet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://rezekibet88.org/
sensa77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sensa77.biz/
sensa888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sensa888.biz/
singajp88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://singajp88.com/
sr77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sr77.org/
sr88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sr88.org/
surya77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://surya77.biz/
surya88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://surya88.asia/
tajir77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://tajir77.info/
tajir88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://tajir88.biz/
toto122 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://toto122.com/
toto123 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://toto123.biz/
uangvip88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://uangvip88.com/
wajik77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://wajik77.asia/
777neko permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://777neko.org/
88judi permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://88judi.net/
99judi permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://99judi.org/
abcslot88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://abcslot88.asia/
Informasi mengenai KING SLOT, Segera Daftar Bersama king selot terbaik dan terpercaya no satu di Indonesia. Boleh mendaftar melalui sini king slot serta memberikan hasil kembali yang paling tinggi saat sekarang ini hanyalah king slot paling gacor, gilak dan gaco saat sekarang di Indonesia melalui program return tinggi di kingselot serta pg king slot
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kdwapp.com/
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jebswagstore.com
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://demoslotgacor.pro
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
akun demo slot gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
akun slot demo gacor permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
akun demo slot pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
akun slot demo pragmatic permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
akun slot demo permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
akun demo slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://situsslotterbaru.net
slot demo gacor
akun demo slot gacor
akun slot demo gacor
akun demo slot pragmatic
akun slot demo pragmatic
akun slot demo
akun demo slot
situs slot terbaru
slot terbaru